随着宋代香文化的发展，中医学对香药的应用比以往更加普遍。安息香、龙脑香、乳香、龙涎香、木香、没药、阿魏、沉香、苏合香、郁金香、肉豆蔻、白豆蔻、丁香等香药，均出现在宋人编写的药学或方剂学专著中。许多医家也更加注重香药在方剂中的应用——不少香药有理气解郁、化滞开窍的功效，医家通过对香药功能与用法的长期观察和实践，创制了大量应用香药的方剂。

宋代十分重视医药事业，不仅组织人员整理了大量医学古籍，还编撰了多部大型方书。赵宋王朝组织编撰的第一部大型方书《太平圣惠方》中，收录了大量运用香药的方剂，甚至部分方剂以香药命名，如乳香丸、沉香散、木香散等。宋代太医局所属药局的成药处方配本《太平惠民和剂局方》中，也有诸多以香药命名的方剂。其中，“苏合香丸”作为中医芳香开窍类的著名代表方剂之一，具有芳香开窍、行气止痛的功效，可用于治疗中风、中暑、痰厥昏迷、心胃气痛，以及各类急性传染病、结核病、瘀血疼痛等病症。沈括在《梦溪笔谈》中记载，苏合香丸在当时几乎成为百姓家中的必备药，若遇瘟疫暴发，服用此药效果更佳，可起到预防传染病的作用。在现代临床上，苏合香丸能提高急重症患者的存活率，一直受到临床一线医务人员的高度重视。

除官方编撰的方书外，宋代私人编撰的方书也常可见到香药的应用。例如，宋代严用和编撰的《济生方》中的四磨饮，以人参、槟榔、沉香、天台乌药四味药材入方，可治疗七情感伤、上气喘急、胸膈不快、烦闷不食等症。

在香药的治疗方法上，宋代文献大量记载了各类香药疗法，如直接内服法、酒调下法、嗅香法、佩香法、燃香法、熏香法等。宋人创造了丰富多样的疗法，使得香药的临床应用更为广泛。正是由于宋代香药的广泛应用，我国中医学中芳香化湿理气、避秽开窍、止痛活血等治疗方法日趋完善。

由此可见，宋代在香文化发展史及中医学临床史上均具有重要的积极意义。在此后的数百年间，香药在中医学中持续发挥作用，直至今日，中医学仍离不开香药，香文化与中医香药始终相互推动，共同发展与普及。